Passos següents - Transcripció del vídeo¶

Traducció assistida per IA - més informació i suggeriments

Notes importants

Aquesta pàgina mostra només la transcripció. Per a instruccions completes pas a pas, torneu al material del curs.

Benvinguda¶

Felicitats, ho heu aconseguit!

Heu arribat al final i heu completat el curs de formació Hello Nextflow. Esperem de veritat que l'hàgiu gaudit. Gràcies per haver-nos acompanyat fins al final, i apreciem molt el temps i l'esforç que heu dedicat a aprendre Nextflow. Esperem sincerament que us sigui útil per a la vostra feina.

Altres cursos a training.nextflow.io¶

No oblideu tornar a training.nextflow.io. Afegim nous cursos breus constantment i també actualitzem molt del material que ja hi ha. Així que aquest curs de formació Hello Nextflow s'actualitzarà amb el temps.

Això és especialment important perquè estem actualitzant la sintaxi de Nextflow, i el 2026 veurem força funcionalitats noves, així que aquest curs tindrà un aspecte i una sensació una mica diferents la propera vegada que el fem el 2027.

Específicament, vull destacar la pàgina "Nextflow for Science". Són cursos breus i estan dissenyats per seguir aquest curs Hello Nextflow. I mostren com utilitzar Nextflow amb diferents casos d'ús específics, ja sigui genòmica o RNAseq, o tot tipus de coses diferents. Intentem afegir més casos d'ús científics constantment.

També hi ha els Side Quests. Quan desenvolupem un curs com Hello Nextflow, hi ha tant que podríem cobrir que és difícil mantenir tot dins l'abast. Així que si hi ha un tema particular que creiem que és interessant per a la gent i que mereix més profunditat, el posem en un Side Quest.

Aneu a fer una ullada i si hi ha coses diferents que puguin ser rellevants per a la vostra feina, com nf-test o fer coses diferents amb metadades i patrons comuns de scripting, consulteu els Side Quests i vegeu si us pot ser útil aprendre'n més.

També hi ha el curs sobre nf-core. Esperem que ja conegueu el projecte a aquestes alçades, però si no, aneu a fer-hi un cop d'ull. Hi ha gairebé 150 pipelines diferents per a diferents tipus d'anàlisi i diferents tipus de dades, així que és totalment possible que hi hagi un pipeline llest per utilitzar directament per al tipus d'anàlisi de dades que necessiteu.

Importantment, també hi ha components a nf-core, gairebé 1700 mòduls diferents, diferents processos i wrappers per a eines. I amb les eines que venen amb nf-core, podeu combinar-los i construir el vostre propi pipeline com peces de Lego. Molt més ràpid i més reproduïble.

Seqera Platform¶

A mesura que augmenteu l'ús de Nextflow, consulteu Seqera Platform, és la millor manera d'executar Nextflow. Podeu executar-lo a la vostra pròpia infraestructura, així que HPC o AWS, Azure, Google Cloud, Oracle i més. També podeu utilitzar el nostre propi Seqera Compute si no voleu gestionar cap infraestructura informàtica.

Seqera Platform realment simplifica la configuració d'aquestes infraestructures de núvol complexes amb funcionalitats com Batch Forge, que crea l'entorn per a vosaltres. I també ajuda molt amb l'observabilitat i el registre d'auditoria i el compliment normatiu.

Objectivament fa que els pipelines s'executin més barats i més ràpids amb tecnologies com Fusion, que optimitzen l'accés al disc i les transferències de dades. I també hi ha optimització de pipelines per assegurar que la configuració dels vostres pipelines estigui tan ajustada com sigui possible.

Hi ha funcionalitats totalment diferents a part d'executar pipelines també. Tenim Studios on podeu executar anàlisis interactives i crear entorns des de qualsevol imatge docker personalitzada que feu. I Data Explorer, que us ajuda a explorar els vostres diferents sistemes de fitxers allà on siguin.

Hi ha un nivell gratuït de Seqera Platform, així que podeu utilitzar pràcticament totes aquestes funcionalitats gratuïtament ara mateix. I fins i tot us donarem cent dòlars de crèdit de computació gratuït amb Seqera Compute si us registreu amb la vostra adreça de correu electrònic organitzacional. Finalment, hi ha un programa acadèmic, així que si treballeu en una universitat, consulteu la pàgina de preus, trobeu el formulari allà i feu-nos-ho saber, i us actualitzarem al Cloud Pro gratuïtament.

Ajuda de la comunitat i esdeveniments¶

D'acord. Cap endavant. Si mai necessiteu suport amb Nextflow, consulteu community.seqera.io. És molt actiu i esperem veure-us allà i discutir els vostres diferents problemes i casos d'ús, i potser ara fins i tot podeu ajudar altres persones.

També tenim molts esdeveniments en marxa. Tenim esdeveniments comunitaris provinents de nf-core i Nextflow. Tenim un hackathon nf-core en línia i distribuït al març, vam tenir més de mil persones que s'hi van unir l'any passat amb seus per tot el món. Així que si us plau, uniu-vos-hi si podeu.

I també tenim esdeveniments Nextflow Summit, un a Boston, i després tenim un esdeveniment a Barcelona i en línia. Xerrades fantàstiques on podeu escoltar sobre gent utilitzant Nextflow de maneres realment massives i salvatges i emocionants. I també hi ha hackathons associats amb aquests i formació presencial.

Podcast i blog de Nextflow¶

Si voleu mantenir-vos al dia amb les coses que passen a l'ecosistema Nextflow, consulteu seqera.io/blog.

Hi ha una secció per a Nextflow allà on podeu escoltar publicacions de blog de la comunitat de gent que treballa a la comunitat, i també publicacions de blog de Seqera sobre actualitzacions de Nextflow i les altres eines que generem.

També m'agradaria fer un anunci del meu projecte personal, que és el Nextflow Podcast. Consulteu-lo a Spotify, o Apple Music, o YouTube. Publiquem nous episodis periòdicament on xerro amb altres persones, ja sigui treballant amb Nextflow o tecnologies associades, o gent de la comunitat. I fem immersions tècniques reals i profundes sobre com funcionen les coses i què està fent la gent. Així que si esteu interessats, consulteu-los. Són molt divertits.

Agraïments¶

D'acord, m'agradaria fer una sèrie d'agraïments. L'equip de formació de Seqera és responsable d'aquest material. Jo estic assegut davant d'una càmera, però realment tota la feina dura l'han feta aquestes altres persones. Menció especial per a Geraldine, que va escriure i ha actualitzat aquest material de formació del curs Hello Nextflow i altres. I també Jon, que ha ajudat molt, especialment amb l'actualització de la sintaxi per a la nova sintaxi de Nextflow i també escrivint molts dels cursos ell mateix. Altres membres de l'equip de desenvolupament científic com Rike, Rob, Florian i molts altres han tingut una gran aportació al material amb el qual hem estat treballant.

També m'agradaria agrair a la gent de la comunitat. Les noves traduccions, per exemple, que són molt noves, han estat molt influenciades per gent del programa d'ambaixadors i d'altres llocs. I realment, la naturalesa de codi obert del material de formació significa que tenim pull requests i issues que arriben amb força freqüència, que realment ens ajuden.

Enquesta¶

Ara que heu acabat, si encara no ho heu fet, si us plau feu ràpidament l'enquesta de comentaris. És al lloc web training.nextflow.io just sota la secció Hello Nextflow.

Només són cinc preguntes. És realment molt ràpid, però això ens permet fer un seguiment aproximat de quantes persones estan fent la formació i també ens podeu dir com millorar el material de formació. Realment comprovem totes les respostes, així que valorem molt la vostra aportació allà.

Comiat¶

Una vegada més, moltes gràcies per unir-vos a nosaltres en aquest curs i en aquest viatge. Deixeu una issue o Pull Request a GitHub si heu detectat alguna cosa al material de formació que creieu que es podria millorar. I realment espero veure-us en un altre curs de formació de Nextflow, o potser en un hackathon o un esdeveniment. Gràcies de nou.