Próximos Passos - Transcrição do Vídeo¶

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Notas importantes

Esta página mostra apenas a transcrição. Para instruções completas passo a passo, retorne ao material do curso.

Boas-vindas¶

Parabéns, você conseguiu!

Você chegou ao final e completou o curso de treinamento Hello Nextflow. Realmente esperamos que você tenha gostado. Obrigado por ficar conosco até o fim, e realmente apreciamos o tempo e o esforço que você dedicou para aprender Nextflow. Esperamos muito que seja útil para o seu trabalho.

Outros cursos em training.nextflow.io¶

Não se esqueça de continuar voltando ao training.nextflow.io. Estamos adicionando novos cursos curtos o tempo todo e também atualizamos muito do material que já está aqui. Então este curso de treinamento Hello Nextflow será atualizado ao longo do tempo.

Isso é particularmente importante porque estamos atualizando a sintaxe no Nextflow, e 2026 verá muitos novos recursos chegando, então este curso terá uma aparência e sensação um pouco diferentes na próxima vez que o fizermos em 2027.

Especificamente, quero destacar a página "Nextflow for Science". Estes são cursos curtos e foram projetados para dar continuidade a este curso Hello Nextflow. E eles mostram como usar Nextflow com diferentes casos de uso específicos, seja genômica ou RNAseq, ou todos os tipos de coisas diferentes. Estamos tentando adicionar mais casos de uso científicos o tempo todo.

Há também os Side Quests. Quando desenvolvemos um curso como Hello Nextflow, há tanto que poderíamos cobrir, e é difícil manter tudo no escopo. Então, se há um tópico específico que achamos interessante para as pessoas, que merece uma cobertura mais profunda, então colocamos isso em um Side Quest.

Vá dar uma olhada e se houver coisas diferentes que possam ser relevantes para o seu trabalho, como nf-test ou fazer coisas diferentes com metadados, e padrões comuns de script, confira os Side Quests e veja se isso pode ser útil para aprender mais.

Há também o curso sobre nf-core. Esperamos que você esteja familiarizado com o projeto a esta altura, mas se não estiver, vá conferir. Há quase 150 pipelines diferentes lá para diferentes tipos de análise e diferentes tipos de dados, então é totalmente possível que haja um pipeline pronto para uso para o tipo de análise de dados que você precisa.

Importante, há também componentes no nf-core, quase 1700 módulos diferentes, diferentes processos e wrappers para ferramentas. E com as ferramentas que vêm com o nf-core, você pode misturar e combinar esses e construir seu próprio pipeline como blocos de Lego. Muito mais rápido e mais reproduzível.

Seqera Platform¶

À medida que você aumenta seu uso com Nextflow, confira o Seqera Platform, é a melhor maneira de executar Nextflow. Você pode executar em sua própria infraestrutura, então HPC ou AWS, Azure, Google Cloud, Oracle e mais. Você também pode usar nosso próprio Seqera Compute se não quiser gerenciar nenhuma infraestrutura de computação.

O Seqera Platform realmente simplifica a configuração dessas infraestruturas de nuvem complexas com recursos como Batch Forge, que cria o ambiente para você. E também realmente ajuda com observabilidade e registro de auditoria e conformidade.

Ele objetivamente faz os pipelines executarem mais barato e mais rápido com tecnologias como Fusion, que otimizam o acesso ao disco e transferências de dados. E há também otimização de pipeline para garantir que a configuração de seus pipelines esteja o mais ajustada possível.

Há recursos totalmente diferentes além de executar pipelines também. Temos Studios onde você pode executar análises interativas e criar ambientes a partir de qualquer imagem docker personalizada que você faça. E Data Explorer, que ajuda você a explorar seus diferentes sistemas de arquivos onde quer que estejam.

Há um nível gratuito para o Seqera Platform, então você pode usar praticamente todos esses recursos gratuitamente agora. E ainda daremos a você cem dólares de crédito de computação gratuito com Seqera Compute se você se inscrever com seu endereço de e-mail organizacional. Finalmente, há um programa acadêmico, então se você está trabalhando em uma universidade, confira a página de preços, encontre o formulário lá e nos avise, e faremos o upgrade para o Cloud Pro gratuitamente.

Ajuda da comunidade e eventos¶

Ok. Indo em frente. Se você precisar de algum suporte com Nextflow, confira community.seqera.io. É muito ativo e esperamos vê-lo lá e discutir seus diferentes problemas e casos de uso, e talvez agora você possa até ajudar outras pessoas.

Também temos muitos eventos acontecendo. Temos eventos da comunidade vindos do nf-core e Nextflow. Temos um hackathon nf-core online e distribuído em março, tivemos mais de mil pessoas participando no ano passado com locais em todo o mundo. Então, por favor, junte-se a nós para isso se puder.

E também temos eventos Nextflow Summit, um em Boston, e então temos um evento em Barcelona e online. Palestras fantásticas onde você pode ouvir sobre pessoas usando Nextflow de maneiras realmente massivas e selvagens e emocionantes diferentes. E também há hackathons associados a esses e treinamento presencial.

Nextflow Podcast e blog¶

Se você quiser se manter atualizado com as coisas acontecendo no ecossistema Nextflow, confira o seqera.io/blog.

Há uma seção para Nextflow lá onde você pode ouvir posts de blog da comunidade de pessoas trabalhando na comunidade, e também posts de blog da Seqera sobre atualizações do Nextflow e as outras ferramentas que geramos.

Eu também gostaria de fazer um plug para meu projeto de estimação, que é o Nextflow Podcast. Confira no Spotify, ou Apple Music, ou YouTube. Lançamos novos episódios periodicamente onde eu converso com outras pessoas, seja trabalhando com Nextflow ou tecnologias associadas, ou pessoas na comunidade. E fazemos mergulhos técnicos profundos reais sobre como as coisas funcionam e o que as pessoas estão fazendo. Então, se você estiver interessado, confira. Eles são muito divertidos.

Agradecimentos¶

Ok, eu gostaria de fazer uma série de agradecimentos. A equipe de treinamento da Seqera é responsável por este material. Estou sentado na frente de uma câmera, mas realmente todo o trabalho duro foi feito por essas outras pessoas. Destaque especial para Geraldine, que escreveu e atualizou este material de treinamento do curso Hello Nextflow e outros. E também Jon, que realmente ajudou, especialmente com a atualização da sintaxe para a nova sintaxe do Nextflow e também escrevendo muitos dos cursos ele mesmo. Outros na equipe de desenvolvimento científico como Rike, Rob, Florian, e muitos outros tiveram uma enorme contribuição no material com o qual estivemos trabalhando.

Eu também gostaria de agradecer às pessoas na comunidade. As novas traduções, por exemplo, que são muito novas, foram fortemente influenciadas por pessoas no programa de embaixadores e em outros lugares. E realmente, a natureza de código aberto do material de treinamento significa que temos pull requests e issues chegando com bastante frequência, o que realmente nos ajuda.

Pesquisa¶

Agora que você terminou, se ainda não o fez, por favor, faça rapidamente a pesquisa de feedback. Está no site training.nextflow.io logo abaixo da seção Hello Nextflow.

São apenas cinco perguntas. É muito, muito rápido, mas isso nos permite rastrear aproximadamente quantas pessoas estão fazendo o treinamento e também você pode nos dizer como melhorar o material de treinamento. Nós realmente verificamos todas as respostas, então realmente valorizamos sua contribuição lá.

Despedida¶

Mais uma vez, muito, muito obrigado por se juntar a nós neste curso, e nesta jornada. Abra uma issue ou Pull Request no GitHub se você notou algo no material de treinamento que você acha que poderia ser melhorado. E realmente espero vê-lo em outro curso de treinamento Nextflow, ou talvez em um hackathon ou evento. Obrigado novamente.